วัดชนาธิปเฉลิม ตั้งอยู่ในเขตเมืองเก่าสตูล มีพื้นที่ทั้งหมด ๔๕ ไร ๔ ตารางวา มีอาณาเขตประกอบด้วย  

• ทิศเหนือ ยาว ๑๑ เส้น ติดต่อกับที่ดินของนางละเอียด พูนพานิช
• ทิศใต้ ยาว ๑๒ เส้น ติดต่อกับที่ดินของนางฮ่อง
• ทิศตะวันออก  ยาว ๔ เส้น ๒ วา ติดต่อกับถนนศุลกานุกูล
• ทิศตะวันตก     ยาว ๔ เส้น ๒ วา ติดกับคลองมำบัง

     ปัจจุบัน พื้นที่วัดซึ่งเดิมเป็นที่ลุ่มได้ถมดินให้สูงขึ้น และสร้างกำแพงรอบบริเวณวัด ภายในเนื้อที่ ๗ ไร่เศษ โดยมีซอยศุลกานุกูล ๔ และซอยศุลกานุกูล ๕ โอบล้อม เป็นทางเข้าออกของชุมชนชนาธิป มีเพียงด้านหน้าวัดซึ่งหันไปทางทิศตะวันออก มีถนนศุลกานุกูลเป็นถนนสายสำคัญสายหนึ่งของอำเภอเมืองสตูลตัดผ่าน