ห้องโถงชั้นล่างของพระบรมธาตุเจดีย์ เป็นที่ประดิษฐานพระประธานพระอุโบสถองค์เดิม ซึ่งเป็นต้นแบบวัตถุมงคลเหรียญพระประธานวัดชนาธิปเฉลิม ๒๔๘๓ ที่สร้างขึ้นเป็นวัตถุมงคลเนื่องในงานผูกพัทธสีมาพระอุโบสถ เมื่อปี พ.ศ. ๒๔๘๓ และเป็นวัตถุมงคลที่มีผู้นิยมวัตถุมงคลรู้จักกันทั่วประเทศ เป็นพระพุทธรูปปางมารวิชัย หน้าตักกว้าง ๓๗ นิ้ว ศิลปะสุโขทัย มีซุ้มเรือนธาตุแบบเดียวกับพระพุทธชินราช หล่อด้วยทองสำริด เฉพาะพระเกศาเป็นสีดำ  ประดิษฐานบนแท่นฐานชุกชีทรงสูง ออกแบบลายลวดบัวสีทองประดับกระจกปี พ.ศ. ๒๕๕๓ ทางวัดได้อัญเชิญพระประธานอุโบสถองค์ เดิมนี้มาประดิษฐานไว้ในห้องโถงพิพิธภัณฑ์ชั้นล่างของพระบรมธาตุเจดีย์